哈密瓜雖然好吃，但是在保存方面卻和其他水果一樣，常溫環境下難以長期保存，許多經銷商紛紛投入到冷庫建造用于延長哈密瓜的保鮮期，在冷庫中控制適宜的溫度和濕度條件，可使哈密瓜腐爛病害減少，糖分消耗降低，貯藏期延長。一般晚熟品種可貯藏3—4個月，有的品種可貯藏5個月以上。在冷庫中貯藏時，可將瓜直接擺放在貨架上，或者用粕、筐包裝后堆碼成垛，或者裝入大木箱用叉車堆碼，量少時也可將瓜直接堆放在地面上。

                  

哈密瓜保鮮儲存還應當注意以下幾點：

1.采收時謹防機械損傷，特別要禁止滾動、拋擲，否則內瓤震動受傷易導致腐爛；

2.哈密瓜采收后，宜在24-27℃條件下放置一段時間，使瓜皮硬化，這對成熟度較差的哈密瓜尤為重要；臨時儲存時要盡量放在陰涼通風處，有條件的可儲存在適宜溫濕度的冷庫內。

3.采收、分級、包裝、運輸哈密瓜時，有條件的盡量在低溫冷庫環境下進行，同時注意輕拿輕放，不要損傷瓜皮。

4.哈密瓜在冬季長途運輸時要注意防凍傷，溫度低于儲存溫度時，要用棉被或塑料布等保溫設備密封覆蓋。

5.保鮮儲存時，應避免哈密瓜直接著地，并要防止陽光暴曬和濕度過高。